董峰平^1,2 , 李海波² , 柳新红² , 周琦² , 陈岗³ , 李因刚^2*

1浙江农林大学林业与生物技术学院,杭州, 311300; 2浙江省林业科学研究院,杭州, 310023; 3杭州市园林绿化股份有限公司,杭州, 310020
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2019年08月22日    接受日期: 2019年08月30日    发表日期: 2020年10月30日

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为了开发乌桕(Triadica sebifera (L.) Small)的简单重复序列(SSR)分子标记，利用 Illumina HiSeq2500测序平台对乌桕嫩叶进行转录组测序，基于测序获得的 59 441条 Unigenes数据，利用 MISA软件进行SSR位点鉴别，通过普通 PCR和毛细管电泳筛选稳定可靠的多态性 SSR标记。结果表明：从乌桕 59 441条Unigenes中鉴定出 7 344个包含 1~6个核苷酸重复类型的 SSR位点，出现频率为 12.36%；单核苷酸、三核苷酸和二核苷酸为优势重复类型，其数量和占比分别为 2 946 (40.11%)、2 314 (31.53%)和 1 958 (21.87%)。从120对随机选择的 SSR引物中筛选出了 10对扩增效率高、稳定性好的多态性 SSR引物。本研究为乌桕现存资源的遗传多样性研究、遗传图谱构建提供了有价值的候选标记。
 

乌桕(Triadica sebifera)；转录组；分子标记；简单重复序列